研究札记
共 8 篇文章
内源性逆转录病毒（ERV）
内源性逆转录病毒（endogenous retrovirus, ERV；人类中常称 human endogenous retrovirus, HERV）是由古老逆转录病毒感染生殖系并固定于宿主基因组的病毒来源 retroelement。ERV 属于广义 retroelement / LTR retrotransposon 相关范畴，在人类基因组中多以失活 p
置换检验
置换检验通过在零假设允许的范围内重新排列观测标签，反复计算检验统计量，构造经验零分布。其核心前提是可交换性：在零假设成立时，被置换的观测单位或标签可以交换，而不改变联合分布。
CODEX空间蛋白组学（Co-Detection by indEXing）
📄 CANVAS 空间肿瘤剖析研究 · IDH 突变胶质瘤空间组织研究
基因组测序与数据格式
📄 BAM与CRAM · MAF格式 · WGS测序文件内容 · GRanges对象 · 变异数据的字段GT、AD、DP · 基因组测序的数据格式缩写
元程序评分的思想与算法
📄 IDH 突变胶质瘤空间组织研究
肺癌转移进化特征
[[raw/科研探索/组会/lung-cancer-metastasis-evolution-2026.md]] 肺癌转移进化特征 论文概要 本研究利用TRACERx前瞻性肺癌研究与PEACE研究性尸检计划的联合队列，对24例[[非小细胞肺癌]]（NSCLC）患者的501个纵向收集的原发和转移肿瘤样
SPP1-SOCS1通路调控肿瘤相关巨噬细胞干扰素应答
SPP1-SOCS1通路调控肿瘤相关巨噬细胞干扰素应答 论文概要 Sun et al. (2026) 在 Immunity 发表研究，揭示肿瘤相关巨噬细胞（TAM）中胞内SPP1通过与TRIM21竞争性结合，抑制SOCS1泛素化降解，从而阻断[[干扰素信号通路]]IFN-γ-STAT1-ISG传导，
肺癌转移进化特征 — 精读报告
拷贝数编译 一、研究背景与核心问题 问题 传统方法局限 本研究突破 转移灶基因组长什么样？ 只能拿到单灶活检 尸检系统采样，覆盖所有转移灶 转移是怎么发生的？ 推测性强 通过进化树反推迁移路径 什么基因组特征驱动远处转移？ 样本不够 大规模多区域采样 + 纵向追踪